تألیفات و تحقیقات آیةالله کلباسی: 
1- تلخیص الدرایه (در علم الحدیث) و تقریرات درس رجال آیةالله زنجانی؛  
2- ترجمه و شرح کتاب سیوطی در  ادبیات عرب؛  
3- حواشی  بر رسائل (فرائد الاصول شیخ )؛
4- حواشی  بر مکاسب محرمه؛
5- حواشی تفسیر قرآن کریم پیرامون بعضی آیات؛ 
6- چهل حدیث حجّ به همراه ره توشه حجاج؛ 
7- شرح حال علمای بیت کلباسی؛
8- رساله‌ای در اخلاق و سلوک؛
9- تاریخ تحلیلی زندگانی امیرالمؤمنین علیه السلام؛ 
10- تاریخ تحلیلی زندگانی امام حسن علیه السلام؛ 
11-تاریخ تحلیلی زندگانی امام حسین علیه السلام؛
12- تاریخ تحلیلی پیام آوران عاشورا ( امام سجاد و حضرت زینب علیهماالسلام)؛
13- تاریخ تحلیلی قیام مختار ثقفی؛ 
14- اول معرفت بعد زیارت (درمعرفت زیارت عتبات)؛
15- فضیلت و اعمال شب نیمه شعبان (لیلة القدر اهل بیت علیهم السلام)؛
16- تفسیر سورۀ قدر به همراه اعمال شب قدر؛  
17- فضیلت و اعمال شب عید فطر و قربان؛  
18- معیار الفقاهة فی الموازنة بین العروة و التحریر (در مبحث اجتهاد و تقلید)؛
19- اندیشه‌های تمدنی آیة‌الله العظمی حاج شیخ محمدرضا کلباسی اشتری
20-  شخصیت سیاسی اجتماعی رکن الملک
21-  تصحیح و تعلیق  بر کتاب انیس اللیل در شرح دعای کمیل؛ 
22- تصحیح  و تعلیق  بر کتاب نفحات اللیل در شرح دعای کمیل؛ 
23-تصحیح و تعلیق بر کتاب منتخــب الرسائل  با حواشی آیةالله العظمـــی حاج   
   شیخ محمدرضاکلباسی اشتری؛ 
24- تصحیح  و تعلیق  بر کتاب مفتاح النجاح فی  شرح دعاءالصباح؛                             
25- تصحیح  و تعلیق  بر کتاب راه اطاعت و بندگی یا طریق العبودیة (در اخلاق و سلوک)؛ 
26- تصحیح  و تعلیق بر کتاب إشراقات الأيام في إفاضات الأنام (در تفسير عرفانی
 بعضی آيات قرآن مجيد) ؛ 
27- تصحیح  و تعلیق  بر کتاب شرح عرفانی بر اشعار خواجه حافظ شيرازی؛
28- تصحیح  و تعلیق  بر کتاب منازل ‏السائرين فی  شرح مقامات العارفين؛ 
29- تصحیح  و تعلیق  بر کتاب دستور تبلیغ دین یا  راهنماي گویندگان و شنوندگان؛
30-    تصحیح  و تعلیق  بر کتاب دعوة الحسينيه (در اسرار نهضت حضرت امام حسين؟ع؟)؛
31- تصحیح  و تعلیق  بر کتاب هدية السالکين (در سير و سلوک)؛
32-تصحیح  و تعلیق  بر کتاب نهج النجاة ( روش نجات در آخرت )؛
33- تصحیح  و تعلیق  بر کتاب مکیال الیقین فی اصول الدین؛​​​​​​​


​​​​​​​همچنین در مؤسسه احیاء تراث (مرکز اشارات) کتاب‌های ذیل تحت اشراف علمی ایشان آماده طبع گردید:
1- اشارات الاصول (دوره کامل اصول فقه در 5 مجلد) تألیف آیةالله العظمی علامه حاج محمدابراهیم کلباسی
2- شوارع الهدایه (فقه استدلالی طهارة و صلاة در 7 مجلد) تألیف آیةالله العظمی علامه حاج محمدابراهیم کلباسی
3- ارشاد المسترشدین (رساله فتوایی در فقه شامل: اکثر ابواب فقه و مناسک حج) تألیف آیةالله العظمی علامه حاج محمدابراهیم کلباسی
4- نخبه (رساله فتوایی در فقه) تألیف آیةالله العظمی علامه حاج محمدابراهیم کلباسی با 30 حاشیه از مراجع بزرگ شیعه در طی 150 سال
5- رساله سؤال و جواب (استفتائات و پاسخ‌ها) تألیف آیةالله العظمی علامه حاج محمدابراهیم کلباسی
6- منهاج الهدایة (دوره فقه در 3 مجلد) تألیف آیةالله العظمی علامه حاج محمدابراهیم کلباسی
7- معراج الشریعة فی شرح منهاج الهدایة (دوره فقه استدلالی در 12 مجلد) تألیف آیةالله العظمی حاج شیخ محمدمهدی کلباسی
8- مصابیح الوصول الی علم الاصول (دوره اصول فقه در 15 مجلد) تألیف آیةالله العظمی حاج شیخ محمدمهدی کلباسی
9- «الاراضی المفتوحة عنوةً» (رساله‌ای در زمین‌های فتح شده توسط مسلمانان) تألیف آیةالله العظمی حاج شیخ محمدمهدی کلباسی
10- «الحدود و التعزیرات» تألیف آیةالله العظمی حاج شیخ محمد کلباسی 
11- التحفة الجعفریه (در مبحث دیات) تألیف آیة‌الله العظمی حاج شیخ محمدجعفر کلباسی
12- الشموس الطالعه (رسائل فقهی آیة‌الله میرزا ابوالهدی کلباسی)
13- قاعدة الید تألیف آیةالله العظمی حاج شیخ محمدرضا کلباسی
41- «فوائد السنیه» در فقه که شامل 6 رساله است: (الأولی فی جواز تعلق الصلح و عدمه بحق الرجوع فی عدة الطلاق الرجعی و مثله، الثانیه فی صحة الصلح من المدیون فراراً عن الدین وعدمه، الثالثه فی مسئلة تعاقب الایادی الغاصبه، الربعه فی مسئلة القرائة خلف الامام، الخامسه فی الغصب، السادسه فی شرایط الاجتهاد و اجازات المصنف)
15- کشف الحجاب فی شرح خلاصة الحساب (شیخ بهائی) تألیف آیةالله حاج شیخ عبدالرحیم کلباسی 
16- شهاب ثاقب (در ردّ رکن رابع شیخیه) تألیف آیة‌الله سید عبدالغفار تویسرکانی به انضمام ردّیه کریم خان کرمانی و جوابیه آیةالله تویسرکانی
17- شرح باب حادی عشر (در علم عقائد) تألیف آیةالله سید صدرالدین محمدبن محمدباقر رضوی قمی